Do najczęściej wykonywanych zabiegów w chirurgii stomatologicznej należą:
- ekstrakcje – usunięcie z zębodołów zębów, których nie daje się uratować w toku leczenia zachowawczego
- usuwanie zębów zatrzymanych, złamanych lub niewyrzniętych, koniecznych do usunięcia ze względu na postępowanie ortodontyczne lub protetyczne
- ekstrakcje zębów mądrości (usuwanie ósemek)
- resekcja wierzchołka korzenia, która polega na odcięciu wierzchołka korzenia wraz z otaczającą zmianą, zwykle wykonuje się ten zabieg na zębach z jednym korzeniem
- hemisekcja – prowadzona na zębach wielokorzeniowych, która polega na usunięciu jednego lub więcej korzeni, z zachowaniem pozostałych
- plastyka połączeń z zatoką szczękową
- leczenie powikłanych ropni
- pobieranie wycinków do badania histopatologicznego
- zabiegi usunięcia włókniaków, nadziąślaków, mukoceli, brodawczaków i innych zmian zapalnych błony śluzowej
- zabiegi usunięcia torbieli kości szczękowych
- przygotowanie jamy ustnej do leczenia protetycznego - kształtowanie wyrostka zębodołowego, usuwanie egzostoz kostnych
- podcinanie wędzidełek